200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23870 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  43.72 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  37.76 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  59.02 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  37.41 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  36.17 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  35.61 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  45.68 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  56.92 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  55.93 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  56.9 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14710  transcriptional regulator, tetR family  39.53 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0751499  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  40.32 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  41.79 
 
 		 71 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1148  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 239 aa  48.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2865  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 254 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  31.34 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3509  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  47.62 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>