296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08850 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 289 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  38.84 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  51.39 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  36.3 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  48.53 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  58.62 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  47.19 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2173  regulatory protein, TetR  36.69 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 246 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  50 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  46.25 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  62.22 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  36.08 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  46.05 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  29 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 280 aa  52  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  40.91 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  37.18 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0267  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614895  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  38.98 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>