More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2375 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  65.43 
 
 		 198 aa  191  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  56.45 
 
 		 188 aa  184  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  56.17 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  57.22 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  57.59 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  58.38 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  48.65 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  45.41 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  52.3 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  53.09 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  50.92 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  41.4 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  43.32 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  42.93 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  38.27 
 
 		 183 aa  100  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 181 aa  95.1  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  31.32 
 
 		 216 aa  85.5  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 236 aa  85.5  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  42.73 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  30.81 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  31.32 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  31.82 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  36.03 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  37.6 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  38.35 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  32.73 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  30.9 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  58.97 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 199 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 252 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>