More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4216 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
215 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
204 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  37.87 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
251 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
289 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  50.55 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  49.44 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  32.26 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  49.44 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  48.31 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  48.78 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  62.07 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  51.39 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  46.99 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 
192 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 
252 aa  72  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  35.35 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  35.95 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 
230 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  43.82 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 
183 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  28.57 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  49.35 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  32.91 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  35.77 
 
 
262 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 
215 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  43.06 
 
 
188 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
231 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 
212 aa  61.6  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 
187 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  33.7 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 
192 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.394377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>