More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1711 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  40.23 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  39.43 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  43.35 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  41.06 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  56.1 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  44.85 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  52.81 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 289 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  44.22 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  38 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  39.5 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  33.51 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  68.42 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.82 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  44.66 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  64.41 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  44.8 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  29.72 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1148  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  32.27 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  33.92 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  35.07 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  54.24 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  34.44 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  35.95 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  28.83 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  31.78 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  45.21 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>