124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5935 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 234 aa  471  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  43.69 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  32.27 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  35.33 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 200 aa  62  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  44.33 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  54.1 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4392  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  34.56 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  41.3 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 208 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  47.46 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5921  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 198 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 198 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 198 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  43.4 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2173  regulatory protein, TetR  42.37 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  45.1  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 201 aa  45.1  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  36.9 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  27.6 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>