More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0550 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  62.62 
 
 		 219 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  58.29 
 
 		 212 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  58.29 
 
 		 221 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  41.35 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  43.16 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  29.05 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  36.36 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 290 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.5 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  25.43 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>