More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2815 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  64.71 
 
 		 221 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  59.17 
 
 		 232 aa  278  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  64.22 
 
 		 220 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  57.76 
 
 		 231 aa  275  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  51.34 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  55.71 
 
 		 225 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  50.22 
 
 		 226 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  48.54 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  46.41 
 
 		 264 aa  181  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  44.67 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 209 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 224 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  34.12 
 
 		 213 aa  99  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 211 aa  98.2  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  32.53 
 
 		 206 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 210 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  33.12 
 
 		 246 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 217 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 195 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  42.5 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  31.01 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  29.61 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  34.26 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  28.47 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
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NC_009674  Bcer98_0376  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
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NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
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NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  47.3 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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