More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1415 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  98.66 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  86.61 
 
 		 224 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  84.38 
 
 		 224 aa  394  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  80.7 
 
 		 228 aa  378  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  62.14 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  60.18 
 
 		 223 aa  255  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  54.31 
 
 		 221 aa  214  8e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 206 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  56.84 
 
 		 214 aa  208  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  49.26 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 212 aa  198  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  48.99 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 216 aa  194  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  47.45 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  43.78 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  47.51 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  38.68 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 271 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 209 aa  98.6  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  32.16 
 
 		 226 aa  95.1  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  29.74 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 220 aa  88.2  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  34.76 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 254 aa  85.1  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  31.05 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  31.66 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 275 aa  75.1  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  29.23 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  32.43 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>