More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3016 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
209 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  51.24 
 
 
218 aa  203  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  50.75 
 
 
220 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  51.26 
 
 
224 aa  198  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  47.03 
 
 
226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  40.53 
 
 
209 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
215 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 
208 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 
201 aa  141  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  40.72 
 
 
202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 
225 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 
206 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  36.87 
 
 
205 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 
221 aa  99.4  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
224 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
216 aa  97.8  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
224 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
238 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
224 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  29.56 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
206 aa  89  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
212 aa  88.6  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
195 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 
212 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
216 aa  85.1  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 
220 aa  85.1  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 
215 aa  84.7  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 
220 aa  84.7  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  29.02 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  30.24 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
330 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  26 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  34.48 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  25.69 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>