More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0293 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  62.05 
 
 		 229 aa  244  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 209 aa  238  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  41.04 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  37.43 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  37.71 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 210 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 213 aa  88.6  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 194 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  31.41 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  26.5 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 317 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27.69 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1210  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0313613  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4369  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4889  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  35.96 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>