More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3349 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  75.38 
 
 		 229 aa  287  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  63.68 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  46.96 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  31.72 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  32.46 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  33.15 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  32.84 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 273 aa  62  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  34.45 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1210  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0313613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.38 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  38.61 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  47.46 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  33.08 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  33.08 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>