More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2497 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  92.35 
 
 		 228 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  62.89 
 
 		 206 aa  234  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  55.2 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 206 aa  225  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  56.57 
 
 		 216 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  53.61 
 
 		 206 aa  204  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  52.66 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  52.97 
 
 		 212 aa  201  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  57.59 
 
 		 206 aa  198  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  54.36 
 
 		 214 aa  181  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  49.22 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  47.94 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  59.89 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  44.86 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 248 aa  111  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  30.21 
 
 		 202 aa  95.1  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  31.5 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 245 aa  88.6  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  34.32 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  40.17 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 197 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  31.53 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 330 aa  74.7  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  38.78 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  28.19 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>