More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1216 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  87.88 
 
 		 199 aa  363  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  63.13 
 
 		 225 aa  263  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  60.51 
 
 		 245 aa  254  7e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  60.1 
 
 		 211 aa  251  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  60.61 
 
 		 271 aa  248  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  60.1 
 
 		 330 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  57.29 
 
 		 218 aa  243  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  58.91 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  56.78 
 
 		 231 aa  240  9e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 197 aa  240  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 197 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  58.05 
 
 		 220 aa  234  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  57.35 
 
 		 215 aa  234  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  57.07 
 
 		 218 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  56.12 
 
 		 200 aa  229  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  54.23 
 
 		 205 aa  227  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  57.44 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  58.59 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  57.36 
 
 		 207 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  57.07 
 
 		 215 aa  221  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  54.36 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  55.38 
 
 		 317 aa  215  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  56.06 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 273 aa  208  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  33.17 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 228 aa  92  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 256 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 219 aa  77.8  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  46.05 
 
 		 248 aa  72  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  50.85 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  29.02 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  30.43 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  25.13 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  35.71 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  37.35 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>