More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0166 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  72.68 
 
 		 205 aa  298  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  75.26 
 
 		 317 aa  295  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  70.26 
 
 		 227 aa  294  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  72.16 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  71.13 
 
 		 200 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  69.9 
 
 		 226 aa  288  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  69.07 
 
 		 215 aa  284  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  70.62 
 
 		 216 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  72.82 
 
 		 271 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  69.59 
 
 		 218 aa  280  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  70.77 
 
 		 225 aa  278  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  64.08 
 
 		 245 aa  275  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  67.69 
 
 		 211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  63.92 
 
 		 197 aa  266  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 197 aa  264  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 212 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 212 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 212 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  66.15 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  62.37 
 
 		 217 aa  261  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  64.8 
 
 		 205 aa  260  8.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  62.44 
 
 		 220 aa  258  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  62.56 
 
 		 218 aa  254  9e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  62.18 
 
 		 207 aa  247  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  60.71 
 
 		 215 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  53.46 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  57.44 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  54.87 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  56.92 
 
 		 199 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.98 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 223 aa  94.7  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  28.65 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 194 aa  62  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  26.92 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>