More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2475 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  434  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  47.7 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  39.15 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  38.65 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 228 aa  118  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  36.45 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  36.62 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  35.27 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  57.14 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  48.81 
 
 		 197 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 271 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  28.36 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  31.92 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  29.76 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  46.75 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  29.76 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 497 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>