More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6941 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  440  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  65.67 
 
 		 211 aa  277  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  66 
 
 		 211 aa  270  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  65.5 
 
 		 211 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  45.23 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  26.95 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  37.12 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  37.12 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  35.34 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1781  regulatory protein TetR  46.24 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  42.62 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  25.31 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  25.31 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  25.31 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  25.31 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  30.43 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  30.43 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  25.31 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  31.58 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  26.78 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  30 
 
 		 287 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>