More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4931 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 497 aa  999    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 446 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  32.35 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 181 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  46.97 
 
 		 220 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  28.71 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 201 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 184 aa  62.4  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  27.22 
 
 		 211 aa  62  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 203 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  47.37 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  50 
 
 		 191 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 209 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 332 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 202 aa  57  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 204 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 204 aa  57  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 205 aa  57  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 324 aa  57  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 211 aa  57  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  38.82 
 
 		 220 aa  57  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 206 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 207 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 204 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 207 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 201 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 184 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 242 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 220 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 198 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 193 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  27.88 
 
 		 193 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 222 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 223 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 223 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 216 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 200 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 211 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 278 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 278 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  47.62 
 
 		 205 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 199 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 212 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 247 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 205 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  34.67 
 
 		 226 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 211 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 221 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 213 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 278 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 197 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 191 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 199 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 199 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 207 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 220 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 194 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 205 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 254 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 203 aa  54.7  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 222 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  44.68 
 
 		 206 aa  54.7  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>