More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1372 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  423  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  68.4 
 
 		 211 aa  285  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  67.92 
 
 		 211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  65.57 
 
 		 211 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  65.38 
 
 		 221 aa  275  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 178 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  31.79 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  41.53 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  31.38 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  31.38 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 244 aa  62  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  43.55 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  61.7 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  32.31 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  31.09 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  31.09 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  31.09 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  31.09 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  31.09 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  31.09 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  31.09 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  54.9 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>