More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1503 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  89.05 
 
 		 213 aa  362  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  90.05 
 
 		 213 aa  340  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  40.5 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  31.82 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  36.07 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  36.07 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  31.45 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  31.45 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  31.45 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  31.45 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  31.45 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  31.45 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  31.45 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  31.17 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  29.61 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  31.82 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  39.24 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  31.97 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  27.01 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4569  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000147437  normal  0.0336832 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>