More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2853 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  99.06 
 
 		 213 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  90.05 
 
 		 215 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  42.38 
 
 		 223 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  40.5 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  34.25 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  39.13 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  39.13 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  31.82 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  33.64 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  30.26 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  30.3 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  30.3 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  30.3 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  30.3 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  30.3 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  30.3 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  30.3 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 125 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 173 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>