More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6228 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  397  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  45.52 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 213 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 223 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  34.09 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 198 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  28.89 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  28.33 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  45.78 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  41.18 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  30.85 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.85 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.85 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.85 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.85 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 244 aa  64.7  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.85 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 247 aa  64.3  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 247 aa  64.3  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  27.78 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  41.43 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 286 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 241 aa  62  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38380  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0126427 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>