More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3066 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  374  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  96.84 
 
 		 190 aa  360  6e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  70.53 
 
 		 190 aa  274  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  69.95 
 
 		 198 aa  256  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  70.37 
 
 		 199 aa  254  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 189 aa  220  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  58.42 
 
 		 187 aa  216  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 192 aa  213  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 192 aa  213  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  57.37 
 
 		 192 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  60.32 
 
 		 186 aa  210  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 187 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  56.61 
 
 		 187 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  59.57 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  43.75 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 198 aa  57  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  22.65 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 307 aa  54.3  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 259 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 240 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  27.16 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  40.35 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>