More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3781 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  33.88 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  30.77 
 
 		 196 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  30.77 
 
 		 196 aa  88.2  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  30.77 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  30.77 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  30.77 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  30.77 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  30.77 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 196 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  31.34 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  28.9 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  28.74 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  46.55 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  46.55 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  25.99 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  27.22 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  31.74 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0811  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.646976  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  26.97 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>