More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1426 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  411  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  41.29 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  37.56 
 
 		 202 aa  111  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  38.22 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  36.36 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  34.59 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  29.33 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  45.95 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  35.96 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  35.96 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  31.88 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1910  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0010144  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 247 aa  61.2  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 247 aa  61.2  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  51.92 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  43.08 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  38.75 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  35.48 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  20.71 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>