More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0995 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  399  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 198 aa  98.6  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 201 aa  86.3  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  29.47 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  28.95 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 201 aa  74.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  25.53 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  26.51 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  27.93 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  27.93 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  27.93 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  27.93 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  27.93 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  27.93 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  27.93 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  51.6  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 209 aa  51.2  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  36.49 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  27.43 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  32.84 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  32.05 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  38.18 
 
 		 278 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 218 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  48.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>