More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1334 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  39.27 
 
 		 199 aa  95.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 220 aa  94.4  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  31.89 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  30.89 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  26.82 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  32.79 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  29.31 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  32.77 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  29.92 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  29.92 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  29.92 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  29.92 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  29.92 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  29.92 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  33.06 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0005  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0576727  normal  0.763846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  29.46 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 257 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  31.54 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02226  transcriptional regulator, TetR family protein  34.12 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>