More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0651 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  44.1 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03806  transcriptional regulator, TetR family  41.95 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  40.39 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5945  regulatory protein, TetR  43.62 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.542251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2697  transcriptional regulator, TetR family  41.61 
 
 		 195 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366203  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6435  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253012  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4138  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3206  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  29.48 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  29.48 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4351  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.710621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  21.71 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  28.72 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  44.83 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  45.92 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  29.1 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  47.46 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  46.25 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>