More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24090 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  435  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 203 aa  98.2  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 197 aa  92  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  35.04 
 
 		 205 aa  85.1  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  25.63 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7911  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0417125  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  27.14 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  44.83 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  46.43 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 324 aa  55.1  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  45.61 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>