More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0820 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 203 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 206 aa  95.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 225 aa  85.5  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  25.98 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  23.89 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  25.25 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 291 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  25.95 
 
 		 184 aa  51.6  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 461 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 126 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5677  regulatory protein  44.26 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 264 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  29.6 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 205 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  45 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  38.98 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>