More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00750 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  100 
 
 
197 aa  407  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  31.63 
 
 
205 aa  95.5  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  29.29 
 
 
209 aa  92  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  31.44 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  28.87 
 
 
207 aa  89.4  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  32.57 
 
 
203 aa  85.9  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
225 aa  84.7  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 
206 aa  84.7  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
215 aa  82  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  28.43 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
211 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  56.86 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 
204 aa  58.5  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 
239 aa  58.2  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
212 aa  58.2  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  43.4 
 
 
230 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  42.42 
 
 
215 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 
234 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
238 aa  55.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
257 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2667  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000274018  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  44.68 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
238 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
227 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  39.34 
 
 
222 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 
189 aa  52.4  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
199 aa  52  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
208 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
247 aa  52  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
247 aa  52  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
212 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 
220 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
273 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4366  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 
211 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00655225  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1185  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
223 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
231 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
215 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 
183 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  30.33 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1578  regulatory protein TetR  31.62 
 
 
231 aa  51.2  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
197 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 
226 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 
255 aa  51.2  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  28.03 
 
 
198 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  33.87 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
210 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
273 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  33.87 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
273 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
273 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  46.43 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  33.87 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3008  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  38.98 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>