More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2311 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
205 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 
206 aa  134  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 
204 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 
220 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  29.74 
 
 
203 aa  105  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
202 aa  97.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  29.65 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  31.63 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  28 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 
212 aa  82  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  29.06 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  25.12 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  29.85 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 
213 aa  61.6  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
205 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 
206 aa  58.5  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  20.86 
 
 
184 aa  55.5  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 
197 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
174 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1313  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  33.91 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
201 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 
213 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 
211 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
199 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
228 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 
197 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
214 aa  52.4  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
231 aa  52.4  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
215 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  53.06 
 
 
201 aa  52.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
205 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
218 aa  52  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 
215 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  46.43 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
540 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  28.3 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 
207 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
234 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
212 aa  50.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  38.1 
 
 
184 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 
445 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
291 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
204 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
201 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
332 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  45.61 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 
245 aa  49.3  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  42 
 
 
207 aa  49.3  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 
192 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 
218 aa  49.3  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
211 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 
224 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 
238 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>