More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1953 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  29.15 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  35.44 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  33.72 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 318 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 316 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 318 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 318 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 318 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 316 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 316 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  19.12 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 310 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 244 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 317 aa  52  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  35.8 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  37.18 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  23.08 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  35.06 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.72 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  34.69 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.69 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.69 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.69 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>