More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6216 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  32.69 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  39.56 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  39.56 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  38.82 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 125 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  42.42 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 335 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 271 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  42.25 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 223 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  23.81 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2188  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106219  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>