More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3950 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  72.86 
 
 		 219 aa  308  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  58.77 
 
 		 211 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  61.5 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  63.4 
 
 		 208 aa  242  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  49.04 
 
 		 213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 201 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 201 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 201 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  38.62 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 260 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.8 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  24.63 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  25.49 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>