More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0571 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  94 
 
 		 200 aa  384  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  84 
 
 		 200 aa  350  5.9999999999999994e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 204 aa  221  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  36.76 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  36.11 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 286 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  22.5 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  47.37 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.37 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5677  regulatory protein  33.33 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.37 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.37 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.37 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  47.37 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.37 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.37 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.62 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  46 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  25.75 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.45 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.45 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  47.92 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.45 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.45 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0237  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000134845  hitchhiker  0.00000000249443 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.45 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  20.49 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  43.4 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  44.9 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.4 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.4 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.4 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.4 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>