More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3049 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  85.43 
 
 		 201 aa  333  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  56.28 
 
 		 205 aa  225  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  54.59 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  55.22 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  49.74 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  48.45 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  50.71 
 
 		 217 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 202 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  27.84 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.69 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  31.28 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  31.44 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  25.58 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  28.12 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>