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for query gene Rmet_3149 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  480  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  85.57 
 
 		 211 aa  360  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  77.32 
 
 		 236 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  73.93 
 
 		 236 aa  331  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  73.91 
 
 		 236 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4794  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 209 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 770 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 207 aa  62  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  22.73 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  24.27 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  25.3 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  25.27 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
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NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  26.9 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
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NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
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NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
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NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
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