More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2441 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  427  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  96.1 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  93.66 
 
 		 207 aa  400  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  92.68 
 
 		 205 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  90.69 
 
 		 209 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  90.2 
 
 		 209 aa  384  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  90.69 
 
 		 207 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  90.69 
 
 		 207 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  90.2 
 
 		 207 aa  383  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  90.69 
 
 		 209 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  25.89 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  28.92 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.99 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  30.21 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  45.31 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  23.78 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  27 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  47.54 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  22.01 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  27.17 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  20.51 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  19.67 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>