More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3892 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  57.95 
 
 		 231 aa  197  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  50.35 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  45.27 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  34.56 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  55.93 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  27.63 
 
 		 265 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
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