More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3720 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  65.61 
 
 		 213 aa  214  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  48.33 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  47.4 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 196 aa  111  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 193 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  99  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 221 aa  94.7  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 269 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 209 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 195 aa  85.1  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  34.1 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 346 aa  68.2  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  28.78 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  29.73 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  35.07 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  25.29 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  38.3 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.72 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  28.85 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  26.29 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.53 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.19 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 291 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>