More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4429 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  72.57 
 
 		 208 aa  247  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 223 aa  104  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  34.71 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 210 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  37.21 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 210 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  35.03 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  39.41 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 218 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 203 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 221 aa  95.9  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 222 aa  92  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  35.43 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 216 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  31.07 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  53.12 
 
 		 280 aa  74.7  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  32.1 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  45.76 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  48.15 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 332 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>