More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2853 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  51.91 
 
 		 209 aa  191  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  53.55 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  43.41 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  46.74 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  35.98 
 
 		 214 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  30.22 
 
 		 219 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 269 aa  92.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 224 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 214 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  31.87 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  30.36 
 
 		 212 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  31.76 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 291 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  22.66 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.63 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  26.82 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 280 aa  53.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  26.83 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 232 aa  51.6  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 346 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  23.88 
 
 		 215 aa  48.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 310 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.73 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.73 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.73 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>