More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1944 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 204 aa  124  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 189 aa  91.3  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  35.67 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  34.09 
 
 		 214 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  32.72 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  30.23 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  30.12 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  28.16 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  28.88 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  27.95 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 245 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  31.65 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  43.55 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 291 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  42.65 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 263 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>