More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2449 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4581  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.133815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3503  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 253 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1448  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0355171  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  45.78 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 271 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  37.11 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27.98 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 400 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.03 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.03 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.03 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 254 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 248 aa  53.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  34.07 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 288 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 288 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 231 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 321 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  31.82 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 321 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 321 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 321 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  36.36 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  29.41 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2026  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 260 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  29.46 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  34.95 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 228 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>