More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2258 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  43.61 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  39.06 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  39.23 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  40.74 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  26.04 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  29.5 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  39.66 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  43.48 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  41.89 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  28.74 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  37.7 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 258 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  27.36 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  35.63 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  36.04 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 291 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  38.71 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  38.71 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  38.71 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  38.71 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  38.71 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  38.71 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 189 aa  48.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  38.71 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 237 aa  48.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  38.71 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  38.71 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  38.71 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  38.71 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  38.71 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  38.71 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>