More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4432 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  72.57 
 
 		 197 aa  261  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  33.7 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 		 193 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  34.44 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  32.32 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  34.24 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 218 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  32.66 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  34.91 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 196 aa  88.2  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  36.48 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  58.18 
 
 		 280 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  45.31 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  28.26 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  32.89 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>