285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3859 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  22.28 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1498  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0699971 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  21.29 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  22.11 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  22.11 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3580  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.08 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  24.19 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  22.11 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3750  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.08 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.833551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  22.11 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  22.11 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  22.11 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  22.11 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.08 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3653  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.08 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.451581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  22.44 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  22.44 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.44 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.44 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3687  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.08 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0386851 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  22.44 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.44 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.44 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  22.11 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.44 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.44 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  21.16 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  28.27 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  22.06 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  25.53 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  22.17 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  18.41 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  18.41 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  18.41 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  21.57 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  18.32 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  21.18 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  21.51 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  23.79 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  20.69 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 269 aa  49.7  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  19.69 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  24.02 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1519  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1542  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1617  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.0770376 
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  21.13 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 269 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>