More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1617 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1617  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
221 aa  446  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.0770376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1597  TetR family transcriptional regulator  92.06 
 
 
215 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703325  normal  0.531377 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1141  TetR family transcriptional regulator  91.59 
 
 
215 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1621  TetR family transcriptional regulator  92.06 
 
 
215 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1542  TetR family transcriptional regulator  91.12 
 
 
215 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1519  TetR family transcriptional regulator  91.12 
 
 
215 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4766  TetR family transcriptional regulator  90.19 
 
 
215 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  76.81 
 
 
223 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  76.81 
 
 
223 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  76.81 
 
 
223 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  76.81 
 
 
223 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  76.81 
 
 
223 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  76.81 
 
 
223 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  74.88 
 
 
209 aa  315  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38380  putative transcriptional regulator  58.74 
 
 
210 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0126427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
211 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3268  transcriptional regulator  54.89 
 
 
217 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
239 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
223 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
223 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
242 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.56 
 
 
211 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  37.56 
 
 
211 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.56 
 
 
211 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  34.91 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.09 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.09 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.09 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
211 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
219 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 
219 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
211 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
210 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
213 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
213 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
213 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
234 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
234 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
210 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  32.39 
 
 
219 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
261 aa  92  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.52 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.62 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.57 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.05 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 
238 aa  82  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.24 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.24 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.24 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  29.91 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.83778 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  28.71 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  28.71 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.71 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.71 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.71 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.71 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.71 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.22 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
230 aa  72  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  27.22 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.22 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.22 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.22 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  27.22 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.22 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.22 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.67 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.11 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.11 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.29 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.11 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.11 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.11 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>