More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3445 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  403  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1498  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0699971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  28.88 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2026  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  30.86 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  29.2 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  25.97 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.97 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.97 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.97 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.97 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.97 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  22.53 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 189 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  27.61 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  30.58 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  28 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1823  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>